哈尔滨医科大学第二临床医学院建立于1954年,是集诊疗、教学、科学研究为一体的三级甲等医院。是全国医院中率先通过法国BVQI认证机构ISO9002质量体系认证的医院。哈尔滨医科大学第二临床医学院占地50万平方,是全国医院中占地面积较大的一所医院。总建筑面积22万平方。有一个门诊部、四个住院处,医院病床有1300张,年出院患者26000人数。在编员工2107人,其中教授有179人,副教授职称有227人。哈尔滨医科大学第二临床医学院设立38个临床医学部门,23个医技科室。
哈尔滨医科大学第二临床医学院有地方新药临床试验研究所,地方药物临床实验基地,黑龙江肝脏移植中心、风湿研究室、心血管外科研究室、黑龙江普通高校药物药理重点实验室、麻醉基础理论与研究重点实验室及哈尔滨医科大学血液疾病研究室、药学药物研究所、呼吸病研究室。哈尔滨医科大学第二临床医学院有伽玛刀、MRI、螺旋CT、DSA、ECT等先进的医疗器械。有中国医院中优等的科研中心和临床实验中心。